Situata al centro del Tavoliere, si è sviluppata soprattutto dopo le opere di bonifica. Già capoluogo della Capitanata, è sede della Fiera Internazionale dell’Agricoltura e della Zootecnia  e importante nodo stradale e ferroviario, nonché terminale degli antichi tratturi della transumanza.

Nonostante il terremoto del 1731 e i bombardamenti che colpirono la città durante la seconda guerra mondiale, conserva nel centro storico diverse testimonianze del suo passato.
Foggia sorge al centro del Tavoliere delle Puglie, tra il torrente Celone e il fiume Cervaro, a metà strada tra il golfo di Manfredonia, il promontorio del Gargano e i monti della Daunia.

Il territorio sorge in un’area geografica pianeggiante e presenta un’escursione altimetrica di 291 metri, con un’altitudine compresa tra i 19 e i 310 metri. La casa comunale si trova a 76 m s.l.m..

La città giace su terreni di origine argillosa, soggetti a elevato ristagno idrico. Essa rientra nella zona indicata a sismicità media.